土壤有機質(zhì)來源十分廣泛。土壤有機質(zhì)可分成腐殖質(zhì)和非腐殖質(zhì)。微生物是土壤有機質(zhì)的最早來源。下面幾種成分是土壤有機質(zhì)的重要來源：
1、植物殘體：包括各類植物的凋落物、死亡的植物體及根系。這是自然狀態(tài)下土壤有機質(zhì)的主要來源。森林土壤相對農(nóng)業(yè)土壤而言，具有大量的凋落物和龐大的樹木根系等特點。熱帶雨林凋落物干物質(zhì)量可達16700kg/(km2·a)，而荒漠植物群落凋落物干物質(zhì)量僅為530kg/(hm2·a)。
2、動物、微生物殘體：包括土壤動物和非土壤動物的殘體，及各種微生物的殘體。這部分來源相對較少。但對原始土壤來說，微生物是土壤有機質(zhì)的最早來源。
3、動物排泄物和分泌物：土壤有機質(zhì)的這部分來源雖然量很少，但對土壤有機質(zhì)的轉(zhuǎn)化起著非常重要的作用。
4、廢水廢渣：施入土壤中的各種有機肥料（綠肥、堆肥、漚肥等），工農(nóng)業(yè)和生活廢水，廢渣等，還有各種微生物制品，有機農(nóng)藥等。在傳統(tǒng)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中，農(nóng)夫大量收集人和動物的排泄物，來滿足植物營養(yǎng)并維持耕地有機質(zhì)的。
進入土壤中的有機質(zhì)一般以3種類型狀態(tài)存在。
1、新鮮的有機物：指那些進入土壤中尚未被微生物分解的動、植物殘體，它們?nèi)员Ａ糁械男螒B(tài)等特征。
2、分解的有機物：經(jīng)微生物的分解，已使進入土壤中的動、植物殘體失去了原有的形態(tài)等特征。有機質(zhì)已部分分解，并且相互纏結(jié)，呈褐色。包括有機質(zhì)分解產(chǎn)物和新合成的簡單有機化合物。
3、腐殖質(zhì)：指有機質(zhì)經(jīng)過微生物分解后并再合成的一種褐色或暗褐色的大分子膠體物質(zhì)，與土壤礦物質(zhì)土粒緊密結(jié)合，是土壤有機質(zhì)存在的主要形態(tài)類型，占土壤有機質(zhì)總量的85-90%。
進入土壤的有機物質(zhì)的組成相當(dāng)復(fù)雜，土壤有機質(zhì)組成取決于進入土壤的有機物物組成。各種動、植物殘體的化學(xué)成分和含量因動、植物種類、器官、年齡等不同而有很大的差異。一般情況下，動植物殘體主要的有機化合物有碳水化合物、木質(zhì)素、蛋白質(zhì)、樹脂、蠟質(zhì)等。土壤有機質(zhì)的主要元素組成是C、O、H、N，分別占52%-58%、34%-9%、3.3%-4.8%，3.7%-4.1%。
有機質(zhì)只有進入土壤才能夠形成天然中的穩(wěn)定成分，這個過程是通過礦質(zhì)化過程完成的，必須有微生物的參加。有機質(zhì)礦質(zhì)化過程分為化學(xué)轉(zhuǎn)化過程、動物轉(zhuǎn)化過程和微生物的轉(zhuǎn)化過程。這一過程使土壤有機質(zhì)轉(zhuǎn)化為二氧化碳、水、氨和礦質(zhì)養(yǎng)分（磷、硫、鉀、鈣、鎂等簡單化合物或離子），同時釋放出能量。這一過程為植物和土壤微生物提供了養(yǎng)分和能量，并直接或間接地影響著土壤性質(zhì)，同時也為合成腐殖質(zhì)提供了物質(zhì)基礎(chǔ)。
耕地退化是在破壞自然生態(tài)系統(tǒng)而來的，耕地中的有機質(zhì)最初是來自天然植物群落土壤封存。中華民族很早就有“用地養(yǎng)地”的良好習(xí)慣，中原地區(qū)很多耕地連續(xù)耕作了四五千年，基本不退化，就是用了生態(tài)農(nóng)業(yè)的辦法養(yǎng)地。縱觀今天，內(nèi)地耕地連續(xù)使用化肥、農(nóng)藥、農(nóng)膜、除草劑短短不到40年，就出現(xiàn)了嚴(yán)重的退化；草原、荒漠綠洲開墾的耕地，起初有機質(zhì)很高(>5%)，但使用不到10年就嚴(yán)重退化，直到成為荒漠。我們的祖先肯定是不會在風(fēng)口上開墾土地的，只有那些沒有節(jié)制的資本才可以任性胡來。
