生物有機(jī)肥營養(yǎng)物質(zhì)釋放緩慢。以氮素營養(yǎng)而言，多以NH4+或氨基酸形式供給植物，進(jìn)入植物細(xì)胞后無需消耗大量能量和植物光合作用產(chǎn)物，如糖分和有機(jī)酸等，直接參與植物細(xì)胞物質(zhì)的合成，故植物生長快，積累的糖分等物質(zhì)多，自然農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量好，且很少有硝酸鹽等有害物質(zhì)污染。在巴戟天的種植中應(yīng)用生物有機(jī)肥，巴戟天的有效成分甲基異茜草素-1-甲醚、醇溶性糖及多糖均有不同程度的增加。

　　2，提高土壤肥力，改善土壤理化性質(zhì)

　　土壤有機(jī)質(zhì)直接影響著土壤的保肥性、保水性、緩沖性和通氣狀況等。因此，土壤有機(jī)質(zhì)含量是衡量土壤肥力的一項重要指標(biāo)，是土壤肥力的物質(zhì)基礎(chǔ)。

　　施用生物有機(jī)肥不僅能補(bǔ)充被消耗的植物養(yǎng)分，而且還能不斷提高土壤有機(jī)質(zhì)含量。在煙草的種植中應(yīng)用生物有機(jī)肥，使土壤的有機(jī)質(zhì)含量得到了增加。在蘋果園中施用生物有機(jī)肥后，有機(jī)質(zhì)含量較對照增加75.8%，土壤容重較對照降低12.50%，毛管孔隙度增加9.8%，可以明顯改善土壤結(jié)構(gòu)，增加土壤孔隙度，提高土壤保水保肥和通氣能力。

　　有機(jī)質(zhì)經(jīng)微生物分解，縮合成新的腐殖質(zhì)，它能與土壤中的粘土及鈣離子結(jié)合，形成有機(jī)無機(jī)復(fù)合體，促進(jìn)土壤中水穩(wěn)性團(tuán)粒結(jié)構(gòu)的形成，從而可以協(xié)調(diào)土壤中水、肥、氣、熱的矛盾，改善土壤結(jié)構(gòu)，使土壤疏松，耕性變好。

　　3,增加土壤向作物提供營養(yǎng)的能力

　　一般情況下，生物有機(jī)肥料中添加有固氮微生物，該類微生物主要通過其中固氮酶的作用，將空氣中的N2還原為可被作物吸收利用的NH4+。微生物的固氮效率因土壤條件的不同而有較大差異。

　　生物有機(jī)肥中還添加了一定數(shù)量的溶磷微生物和硅酸鹽細(xì)菌，施入土壤后經(jīng)增殖并與其它土壤微生物協(xié)同作用，可分解土壤中某些原次生礦物，并同時將這些礦物所固定的磷、鉀等養(yǎng)分釋放出來，把無效態(tài)磷、鉀轉(zhuǎn)化成可供作物吸收利用的有效態(tài)養(yǎng)分，直接被作物吸收利用，提高土壤供肥能力。

　　4，改善土壤微生態(tài)系統(tǒng)，提高土壤生物肥力的水平

　　一般腐熟的有機(jī)肥中含有酵母菌、乳酸菌、纖維素分解菌等有益微生物，而加有功能菌的生物有機(jī)肥還可能含有固氮菌、硅酸鹽細(xì)菌、溶磷微生物、光合細(xì)菌及假單胞菌等一些有益菌。這些微生物除了具有產(chǎn)生大量活性物質(zhì)的能力外，有的還具有固氮、溶磷、解鉀的能力，有的具有抑制植物根際病原菌的能力，有的則具有改善土壤微生態(tài)環(huán)境的能力。

　　生物有機(jī)肥施入土壤后能夠調(diào)節(jié)土壤中微生物的區(qū)系組成，使土壤中的微生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)發(fā)生了改變。在果園施用生物有機(jī)肥后，根區(qū)土壤細(xì)菌、真菌和放線菌數(shù)量顯著增加，其中細(xì)菌占絕對優(yōu)勢。這是因為當(dāng)有新鮮有機(jī)物質(zhì)進(jìn)入土壤后，為微生物提供了新的能源，使微生物在種群數(shù)量上發(fā)生較大的改變。

　　在我國現(xiàn)有的耕作栽培管理體系下，如長期連作、過多地依賴化肥、不合理或過多使用農(nóng)藥等，造成土壤微生物和土壤動物組成向惡劣方向發(fā)展，不僅有害微生物群體數(shù)量上升，而且降低了土壤生物肥力水平，這可能是今后可持續(xù)發(fā)展中值得重視和加強(qiáng)研究的。

　　微生物是生物肥力的核心，是共同構(gòu)成土壤肥力不可或缺的核心組分。人工接種微生物，即施用生物有機(jī)肥,是維持和提高土壤肥力的有效手段。

　　5,減少或降低植物病蟲害的發(fā)生

　　生物有機(jī)肥具有改善土壤生態(tài)環(huán)境及土壤微生物區(qū)系的作用，在減少作物病蟲害發(fā)生方面發(fā)揮著更為重要的作用。這是因為在生物有機(jī)肥中含有多種非病原微生物菌群，在微生物的生長繁殖過程中，具有競爭性抑制作用，并能分泌出多種抗生素、殺蟲物質(zhì)及植物生長激素，不但能抑制植物病原微生物的活動，起到防治植物病害的作用，而且能刺激作物生長，使其根系發(fā)達(dá)，促進(jìn)葉綠素、蛋白質(zhì)和核酸的合成，提高作物的抗逆性。

　　如利用畜牧業(yè)廢棄物資源研制的生物有機(jī)肥對番茄青枯病有明顯的控制作用，在連作地對照土壤番茄青枯發(fā)生率100%的情況下,腐熟的生物有機(jī)肥處理番茄平均發(fā)病率46%，方差分析表明，施生物有機(jī)肥顯著地降低了番茄青枯發(fā)生率。